解决了大燕国的外患，本以为可以松口气的慕容家族，又将面临一个头疼的问题。慕容家的内讧开始了，足浑母子排挤慕容垂，无奈慕容垂投奔苻坚 ，慕容评认为慕容德与之交好，遂迁怒于他，将其免职。失去了慕容垂这个顶梁柱，大燕国一下子就垮塌了，后秦苻坚派王猛征战大燕，没费多少力 就把燕国给灭亡了，而慕容德就和整个家族迁徙到了长安。苻坚对慕容家族的人都不错，不仅安顿了家族的人，还让慕容德做了张掖太守，戍边去了 。
淝水之战后，苻坚和张夫人失散，慕容暐欲护送张夫人回洛阳，慕容德说这个女人不祥，我们就当做没看到，何必在乎呢？慕容暐顾念苻坚恩义，坚 持不从。慕容德见慕容暐不是“成大事者”，遂离去投奔慕容垂。没想到，慕容垂也不是一个“成大事者”，淝水之战，苻坚惨败，仓惶逃走的时候 ，身边一个亲信都没有，正是下手的好时机，但是慕容垂却不肯加害于苻坚，反而把自己的军队交给苻坚。慕容德则说，“秦强而并燕，秦弱而图之 。”我们所做的一切不过是为了复国而已，这世上哪有什么仁义的战争。从上可知，慕容德是个一心谋大事的人，在他的心里只关心政治，为了复国 他可以不顾及信誉、恩情。
慕容垂是有名的豪杰，他的志向在天下。最后他也得以建立了后燕，而追随他的慕容德被封为范阳王、车骑大将军，虽然慕容德品德为人诟病，但他 的才能确实出类拔萃。慕容垂每有不决，必与其商议，称为“二人同心，其利断金”两兄弟的感情很好。慕容德对慕容垂忠心耿耿，但只限于慕容垂 一人，因为慕容垂不光是他从小交好的兄长，还拥有令人仰视的军事才华。眼看着慕容垂的江山越做越大，却出现了一个令燕国无可奈何的强敌。拓 跋氏的崛起太突然了，以致于慕容家两兄弟都始料未及，拓拔氏如同慕容氏的克星一样，专门欺负慕容家族。那些曾经叱咤风云的慕容将领们，面对 拓拔北魏的进逼竟不堪一击。后燕分崩离析的时代说到就到。
396年，慕容垂临终，遗命太子慕容宝将邺城（今中国河南省临漳县）委由慕容德镇守。次年，慕容德又受慕容麟（慕容垂另一子）建议先称燕王， 称燕王元年，史称此一政权为南燕。400年，慕容德正式称帝，改元建平。没做几年皇帝，慕容德就病逝，享年七十岁。慕容德可能心中有愧，生怕 死后被人掘墓，所以在去世当晚，有十几个棺木从四方城门抬出，秘密葬在某个山谷之中，后人竟无法得知其尸体之所在。