妙玉和林黛玉，单看二人名字里所带的“玉”字，足可见作者对二人的重视。虽然妙玉出场极少，但作者对其的喜爱之意，溢于言表。“玉”这个字对作者而言，应该是极为重要的一个字，红楼梦中担的起这个“玉”字的都有谁，相信大家并不陌生。而以妙和玉组成人名，足可见其特殊意义。
妙玉和黛玉两个姑娘，可以说是有许多相似之处的。
首先两人气质相似，都是清雅脱俗的女子。太虚幻境“红楼梦”曲子说黛玉“世外仙妹，同苑仙葩”，说妙玉“气质美如兰，才华薄比仙”。作者对于这两个人的判断，都是以仙作比的，可见这两人在作者眼里都是那种出尘妙人。
二是两人的遭遇相似。林之孝家的说妙玉“本是苏州人氏，祖上也是读书仕宦之家”，而林黛玉祖籍也为姑苏人世，是扬州巡盐御史林如海的独女，开国元勋之后，四代袭爵。两人都是姑苏人士，都是官宦世家出身。另外这两位姑娘一个自由多病，一个先天不足，父母又都双双亡故，而寄居贾府之中。这两个神仙似的妙人，最后的结果都不好，。一个是“苦绛珠魂归离恨天”，一个是“无暇白玉遭泥陷”。心愿俱违，怨愤俱深。
第三两个人的性情为人都极为相似。一个爱说就说，爱恼就恼，一个则“万人不入他的耳目”。黛玉看不起权贵，北静王的零苓香念珠被她骂作“什么臭男人拿过的东西”。妙王也正是因为不喜奉迎，被“权势不容”。这两人除了性情相似之外，竟然还爱上了同一个男人。而且在这场爱恋之中，两人都没有得到自己想要的结局，最终惨淡收场。
当然如此相似的两人，自然也有不同之处。
首先两人在贾府的境遇，所过的生活不同。林黛玉是贾母的外孙女儿，其母亲是贾母最爱的子女贾敏，因此爱屋及乌之下，对林黛玉极为疼爱。林黛玉在贾府虽是寄居，可是却比贾母的几个亲孙女儿过的还要好，是真正的闺阁名媛生活。而妙玉呢，自小遁入佛门，师傅去世后，被请到大观园居住。在贾府她自然是比不上林黛玉的，与她终日相伴的是青灯古佛，她的内心是寂寞的。
其次两人虽然都爱上了贾宝玉，但两人对爱情的态度相差极大。林黛玉如飞蛾扑火一般，追求这自己的爱情，努力冲破封建礼教的束缚，希望自己的感情能有一个好的结果。而妙玉虽然向往爱情却又害怕爱情、禁锢爱情，对自己的心意不敢袒露半分。
妙玉虽然出场极少，但她与贾府众人那一丝一缕的关系，却极为繁多。所以到了今天，人们对于她的结局，她的身世，才有了那么多的猜测。
《红楼梦》中妙玉的判词判曲，表现的都是一个意思，就是落入污泥中的宝玉。
判图：画着一块美玉，落在泥污之中。
判词：欲洁何曾洁，云空未必空；可怜金玉质，终陷淖泥中。
判曲（世难容）：气质美如兰，才华馥比仙。天生成孤癖人皆罕。你道是啖肉食腥膻，视绮罗俗厌；却不知太高人愈妒，过洁世同嫌。可叹这，青灯古殿人将老；辜负了，红粉朱楼春色阑。到头来，依旧是风尘肮脏违心愿。好一似，无瑕白玉遭泥陷；又何须，王孙公子叹无缘？
“欲洁何曾洁，云空未必空。”说的是妙玉虽然想要清净，可是却过着世家小姐般讲究的生活。她自己也说，这一只“绿玉斗”，贾家都找不出第二只来，可见其生活精细。虽然遁入了空门，却并没有七情皆空，反而爱上了贾宝玉。出家人应以慈悲为怀，可是在刘姥姥用了茶杯后，鄙夷之色不掩。明确表示，幸好不是自己用过的，若是自己用过了，就是砸了也不给刘姥姥。可见她心里认为刘姥姥是肮脏的，不希望自己和她沾染半分，完全没有出家人普渡众人的情怀。“可怜金玉质，终陷淖泥中。”说的是这位姑娘最后的结局，高鹗续写版的结局是被贼子玷污，可是一些学者研究其人的特殊性，认为妙玉的结局定有另外的意义，绝不会如此简单。不过她的结局，最终没有达到自己洁净来洁净去的愿望，倒是真的。