《圣教入川记》：”张献忠灭后，旗兵在川，……彼时川人不甘服旗人权下者，逃往地方，聚集人马抵抗旗兵，如此约有十载。迨至一千六百六十年间，川省稍定，始行设官。……此时四川已有复生之景象，不幸又值云南吴三桂之乱，连年刀兵不息。自一千六百六十七年至一千六百八十一年，一连十五载，川民各处被搂，不遭兵人之劫，即遇寇盗之害。……四川际此兵燹之后，地广人稀。“
第二种说法，张献忠屠川是清朝统治者陷害的。
明朝大部分典籍，都是清朝时代编撰的。清朝对文化的压制达到了顶点，其中大部分历史记载都不符合史实，存在诬陷的因素在。而且人口锐减的时间与张献忠并不符合，1646年清军宣布张献忠死亡，但是真正平定四川是在1659年攻陷渝城。如果张献忠已经死了，四川人口缺乏，那么又哪儿来那么多人力兵力支撑抗清斗争十多年呢？所以张献忠屠川的说法，是错误的。清军也有屠川记载，《客滇述》记载：”清将梁一训驱残民数千，北走至绵州，又尽杀之，成都人殆尽。“。
第三种说法，张献忠的确屠过川，但是那是为了巩固自己的统治。真正放开了杀只有三天的时间，此后都是每日杀百人，作为警告。
假设张献忠真的屠杀了四川人民，其原因大概就是第三种，为了巩固自己的统治。当时四川许多地主阶级，组成武装势力进行反抗，张献忠镇压示警。至于他们为什么会反抗，很简单。张献忠的一系列作战都需要银钱支撑，所以许多四川的大户地主都是张献忠征收钱银的对象，断人财路有如杀人父母，他们当然要起来反抗。