1452年(景泰三年)，朱祁钰废皇太子朱见深(朱祁镇子)，更立他的儿子朱见济做太子，朱祁钰这种自私的行动，于谦是不赞成的，因此朱祁钰对于于谦渐见疏远，不肯授予于谦以全面行政的实权，仅因防边多事，才使于谦长期专任兵部。于谦对于当时的勋戚贵幸的贪鄙忮懦，多所年轻，因而对于阉党邪派的阴谋活动，也就警惕不够。于谦遇到阉党破坏和捣乱的时候，常愤慨地扪胸叹息，曾说：“此一腔热血，竟洒何地?”表示决不向他们让步。
于谦在用人行政中，对贪污横暴的高级军官，严加劾办。石亨在德胜门外的战功，并不高于于谦，受封世袭的侯爵，自觉愧心，曾上疏推荐于谦长子于冕做都督府前卫副千良。于谦上疏恳辞，并指责石亨位居大将，不选拔军伍中人材，报效国家，单独荐举于冕是不合公论的。同时指出：“臣于军功，决不冒滥，纵欲为子求官，自当乞恩君父，何必假手于石亨”!石亨听到于谦严厉的指责，便积恨在心。石亨身任京营总兵，提督十团营，骄纵枉法，勾结营私，于谦屡次对石亨加以奏劾，石亨更切齿痛恨。另外，都督张軏先后因犯军律，曾被于谦弹劾，也怨恨于谦。太监曹吉祥也因监守军务时被于谦所制裁，平素也甚耿介于心。前任兵部尚书王骥因在正统时党附王振，行为骄纵，景泰时曾受裁抑，但他屡思跋扈，由于于谦不肯推荐，因此也对于谦怀有嫉恨。总之，仅只在改进军务方面，于谦就遭到了许多的阻难。
1453年(景泰四年)，皇太子朱见济忽然病死。后来一部分较正派的官员，主张恢复朱见深做皇太子，遭到朱祁钰的压制。另一方面，复辟的阴谋，却暗地酝酿着，终于爆发了“夺门”的事件。
“夺门”的主角是太上皇朱祁镇，他在土木堡丧师辱国被也先俘虏，幸赖于谦等领导军民抗战胜利，才得被释回国，但是朱祁镇不考虑军国大事和抗战的客观，从而对于于谦等抱有莫大的私憾。朱祁镇回到北京后，朱祁钰已经代替了他的皇位并且把他禁锢在南宫，因此他们兄弟之间是仇恨深重的。“夺门”事件的主要推动者是石亨、徐有贞、曹吉祥、杨善、王骥涨軏等。其中石亨、张軏掌握京营军权，王骥的职务是守备南宫，曹吉祥是京营监军太监。所以走通官禁，有便利条件。他们就利用京营军权，做发动宫廷事变的工具，杨善过去谄附王振，曾做过出使瓦剌的使臣，迎得朱祁镇回国，超出了朱祁钰的旨命，朱祁钰对他不满，后来又向曹吉祥、石亨献媚，自然就密切勾结起来了。徐有贞(即徐理)，在也先入侵时主张南迁，被于谦所驳斥，为舆论所不齿，后来谄附陈循，升官到副都御史。这一群贪残阴险、结党营私的官僚们拼凑到一起，都想利用朱祁钰和朱祁镇兄弟二人的尖锐矛盾，假手为朱祁镇夺回皇位，大搅混水，乘势摸鱼，做自己升官的打算。