自古以来，中国的婆媳关系都很复杂，在日常生活往往会出现失调的情况。毕竟两代人之间，还是存在着很多差异的。而慈禧太后和孝哲毅皇后之间，不仅仅存在着婆媳之间的一般矛盾，还有其他原因，导致了两人关系的不和。
与其说两人之间的关系存在问题，不如说是慈禧太后一人对孝哲毅皇后看不惯。在孝哲毅皇后入宫之后，不仅时常看不惯，虐待孝哲毅皇后，甚至有的时候还出手干预她与同治帝之间的夫妻生活。而两人关系不和，也不仅仅流传在宫闱中，甚至广为人所知。以至于后来，孝哲毅皇后年纪轻轻，身体康健，却与同治帝前后脚去世，给人们留下了很多的谜团。民间传说，孝哲毅皇后之所以那么年轻便死了，正是由慈禧太后逼迫所致。那么问题就来了，慈禧太后到底为什么那么讨厌孝哲毅皇后呢？
首先是因为孝哲毅皇后阿鲁特氏，本来就不是慈禧太后相中的皇后。在给同治帝选择皇后的时候，慈禧太后中意的是凤秀之女，而不是崇绮之女。而阿鲁特氏作为崇绮之女，能当上皇后，是因为慈安太后和同治帝同意的结果。在这方博弈中，很显然慈禧太后是输了。这一先决条件，就决定了孝哲毅皇后很难得到慈禧太后的喜爱。
其次孝哲毅皇后入宫之后，与同治帝夫妻生活幸福，同治帝时常与她待在一起。同治帝只有一个，孝哲毅皇后得到同治帝的宠爱，那么势必就会有其他人受到冷落。慈禧太后中意的皇后人选，凤秀之女入宫之后，封了个慧妃。入宫之后，同治帝并不怎么喜爱她，自然而然的便冷落了她。慈禧太后见孝哲毅皇后得到同治喜爱，而慧妃却被冷落，心里自然不痛快，对孝哲毅皇后的厌恶更深，以至于后来做出了干涉帝后生活的事情。
慈禧太后之所以讨厌孝哲毅皇后，应该还有慈安太后的原因在。慈安太后在的时候，慈禧太后的确事事取得慈安太后的同意才会去做。但这并不代表，慈禧太后真与慈安太后姐妹情深。后宫女人之间，天生就存在着不可调和的矛盾。否则后来也不会流出，慈安太后是被慈禧太后害死的说法。而孝哲毅皇后是慈安太后钦定的皇后，是堂堂正正从紫禁城正门抬入的皇后，是正室。而慈禧太后是选秀入宫，从低阶嫔妃慢慢升至如今的地位。虽然与慈安太后并尊太后，但东宫太后慈安太后因为正妻的原因，地位远高于慈禧，所以慈禧对于嫡庶想来还是有些计较的。