从古籍上看，当时人们不仅吃果实，还吃叶，比如“以叶作菹，去筋净乃妙”，花亦能食，“泡以开水盐渍之，署日以代干菜”，但食花需去其心和须，否则太苦，而南瓜茎则可以“织屦及缫作丝为绦紃等物”。此外还用南瓜泡酒，被认为有利于保健，《本草求原》载：“蒸晒浸酒佳。其藤甘苦、微寒。平肝和胃，通经络，利血脉。”
有趣的是，光绪之前甚少见“南瓜”之说，多以“番瓜”“翻瓜”“蕃瓜”“房瓜”“窝瓜”称之，一方面是说它来自海外，一方面是说它体量巨大，此外还有“金瓜”一说，因为它色泽金黄，且有药用价值。鸦片泛滥时，南瓜常被用作药物，以治疗烟瘾。
南瓜传入中国有多条路径，但以广东、福建、浙江为最早。国人初期误以为南瓜来自日本，故名之为“倭瓜”，因日本在中国之东，所以又称南瓜为“东瓜”，此外还有进一步误会为产自朝鲜半岛，名之曰“高丽瓜”，而日本人则以为南瓜来自中国，所以称它为“唐茄子”（当时日本人将中国产品概称为唐物）。
到了清代中后期，南方南瓜沿大运河向北移栽，特别是山东，成了北方南瓜种植重镇，人们开始意识到此瓜应自南来，“南瓜”之称开始流行。