”太后下嫁“之谜，这个迷案如今许多史学家分析，孝庄的确是嫁过多尔衮的。明朝遗臣张煌言《建夷宫词》就映射了太后下嫁一事。
上寿筋为合卺尊，慈宁宫里烂盈门；
春官昨进新仪注，大礼恭逢太后婚。
慈宁宫为太后居所，这首诗写的就是宫中喜气洋洋张灯结彩，庆祝太后大婚。不过也有人指出，这是明朝旧臣，对清王朝的贬斥，并不可信。但是经过现在对各类史籍的分析，发现孝庄下嫁多尔衮很有可能是真的。清亡后，民国教育部清理礼部档案，发现存档的历科殿试策文中有”皇父摄政王“字样，与”皇上“同格抬写；大库红本档案，也发现顺治四年之后内外奏疏亦多称”皇父“，与蒋良骐《东华录》顺治五年诏封皇叔父为皇父摄政王、顺治八年追论多尔衮罪状诏中”自称皇父摄政王“、”又亲到皇宫内院“等语正相照映，加上孝庄死后不与皇太极合葬，而是独葬关内。从这几点上可以看出，孝庄极有可能确实下嫁过多尔衮。不过并不是小说中写的那样 ，两人互相爱恋。孝庄之所以会选择嫁给多尔衮，更多的是给多尔衮以媲美皇上的权利，而拖延多尔衮篡位的决心。事实证明孝庄做的决定是正确的，她最终拖到多尔衮死去，保住了自己儿子的皇位。
孝庄和康熙是祖孙，孝庄对康熙很爱护，也严格教导，两人极为要好。不像顺治和孝庄，几度有过矛盾。孝庄晚年病危，康熙亲奉汤药，昼夜不离。还亲自率领王公大臣步行到天坛，祈告上苍，请求折损自己生命，增延祖母寿数。祝文上说：”忆自弱龄，早失估恃，趋承祖母膝下，三十余年，鞠养教诲，以至有成。设无祖母太皇太后，断不能致有今日成立，同极之恩，毕生难报……若大算或穷，愿减臣龄，冀增太皇太后数年之寿。“可见祖孙关系多么融洽。