1942年6月，在太平洋中途岛海战中，日本的联合舰队和美国的航空母舰“小鹰”号进行了激战，在这一过程中，一直有一艘神秘的潜艇在旁边悄悄地观战。可当它被双方发现并误以为是敌方的舰只，都对其进行攻击时，它却又一下子消失得无影无踪了。到了美日舰只在马里亚纳群岛激战时，这艘神秘莫测的潜艇又出现了，但它还只作“壁上观”，不支持任何一方。更奇怪的事情还在后面：当一艘日本舰只中弹着火爆炸，水手纷纷跳海逃生时，这艘神秘的潜艇马上驶近现场，救捞起了许多官兵。然后，它开到稍远的地方，让这些官兵坐在两条救生艇里，把艇子放下海，才悄悄地开走。让这些被救官兵感到更迷惑不解的是，在整个过程中，他们始终都没有见到潜艇上的人，只有一个出自喇叭的声音在指挥着他们该这么做该那么做。而且，这艘潜艇的速度和其他各种性能，是当时所有最先进的舰只也难以比拟的。
战争结束后，美国的情报部门曾专门就此事展开调查，却没有什么结果，当时有潜水艇的只有美国和德国、日本等几个国家，但德国和日本都否认曾派遣过潜艇到这些个海战现场。
搜寻幽灵潜艇
由于潜水艇在海战中神出鬼没的特殊功能，在第二次世界大战后，许多国家都竞相研制常规潜水艇和核潜艇。美国和前苏联在这方面更是遥遥领先。但它们也知道，无论它们研制出的潜艇再怎么先进，都远远比不上幽灵潜艇。为了研究和借鉴幽灵潜艇的先进之处，美国和前苏联先后展开了一场对幽灵潜艇的追踪搜寻。
美国海军曾多次动用太平洋舰队几乎全部的潜艇、猎潜艇和其它战舰，还有飞机，在南太平洋海域四次大规模地开展搜寻“幽灵潜艇”的行动。前苏联海军也不甘落后，派出了大批的舰艇和飞机，在太平洋、大西洋进行仔细搜索。搜索行动前前后后历时1年，结果却犹如海底捞针，一无所获，并且，两个国家还为此付出了极大的代价，它们分别有2艘和3艘先进的潜艇失踪。
到了20世纪60年代初，幽灵潜艇更是频频出没于太平洋与大西洋的广阔海域，跟踪美国、前苏联的乃至其他国家的军舰。一次，美国“企业”号核动力航空母舰在南太平洋发现被跟踪，正待作出反应，对方就很快消失在声纳和检测仪的定位之外了。“企业”号派出数架反潜直升机到处搜寻，并投下了多枚深水炸弹，但最终一无所获。前苏联的舰队也遇到过类似的情况。